Ker v sodobnih skladiščih uporabljamo raznovrstno opremo, lahko pri tej pričakujemo tudi določene stroške pri obratovanju na dolgi rok. Številni manjši pripomočki so zelo varčni in so njihovi stroški praktično zanemarljivi, imamo pa opravka tudi z večjimi napravami, ki lahko pomenijo znatne stroške. To so predvsem viličarji, pri katerih moramo gotovo že v izhodišču upoštevati njihovo porabo in druge stroške, ki bodo nastali pri redni uporabi.
Pazimo predvsem na pogon naprave, saj ima ta ključno besedo pri tem, kakšni bodo stroški. Največ denarja zahtevajo prav goriva, ki jih uporabljamo za poganjanje motornih naprav. V tem oziru se najbolje obnese električni viličar, ki ima z učinkovitim delovanjem izjemno nizko porabo, predvsem pa s koriščenjem ugodnega vira energije niti na dolgi rok ne predstavlja visokih stroškov. Z vidika porabe in stroškov za gorivo je električni viličar nedvomno najboljša možna izbira, saj gladko prekaša druge opcije, recimo dizelski pogon. Prav tako pa imajo električni motorji še druge prednosti, ki pridejo do izraza pri dolgoročni uporabi. Obratovalni stroški so odvisni tudi od vzdrževanja in servisiranja vozil, viličarji pa morajo biti vedno pripravljeni na uporabo, torej bodo s tega vidika precej zahtevni. Električni viličar ima dokaj enostaven pogon, ki deluje čisto in učinkovito, ne potrebuje niti posebnega čiščenja niti vzdrževanja. Seveda pride reden servis v poštev tudi pri teh napravah, a je enostavnejši in cenejši.
Če pazimo na obratovalne stroške, je električni viličar gotovo najboljša možna izbira, če seveda s svojimi zmogljivostmi in funkcionalnostmi pride v poštev v določenem okolju. Paziti pa moramo tudi na to, da dobro preračunamo vse stroške, ki jih imamo z opremo. V tem oziru so viličarji z električnim pogonom nekoliko manj prepričljivi, če recimo upoštevamo tudi ceno ob nakupu, ki je praviloma višja kot pri napravah, ki uporabljajo druge vrste pogonov.